医院感染的内源性感染源主要是患者自身的正常菌群或条件致病菌。
内源性感染，即感染源来自患者自身。在正常情况下，人体的皮肤、口腔、呼吸道、肠道、生殖道等部位都有一定数量的微生物寄生，这些微生物在机体健康状态下并不致病，被称为正常菌群。然而，在某些条件下，如机体免疫力下降、菌群失调或长期使用广谱抗生素等因素的影响下，这些正常菌群或条件致病菌可能转变为致病菌，引发内源性感染。
内源性感染的发生机制复杂，以下五点为主要原因：
1、免疫力下降。患者因疾病、营养不良或长期使用免疫抑制剂等因素导致免疫力下降，使得原本不致病的微生物有机会引发感染。
2、菌群失调。长期使用广谱抗生素，如头孢菌素、青霉素、氟喹诺酮类药物等，可能破坏体内微生物的平衡，导致某些细菌过度繁殖而致病。
3、医疗操作。手术、导管插入等医疗操作可能破坏机体的天然屏障，为内源性微生物提供感染机会。
4、慢性疾病。如糖尿病、慢性肾功能不全等，这些疾病状态会降低机体的抵抗力，增加内源性感染的风险。
5、年龄因素。婴幼儿和老年人的免疫系统相对较弱，更容易发生内源性感染。
综上所述，内源性感染是医院感染中不可忽视的一部分，了解其感染源及发生机制对于预防和控制医院感染具有重要意义。
